Un gruppo di scienziati che lavorava all'Isola Cannella è riuscito a clonare il leggendario Mew. Il clone Mewtwo ne esce più intelligente e più spietato. Mewtwo è arrabbiato perchè secondo lui gli umani non devono avere legami con i Pokèmon, così distrugge l'isola per vendicarsi degli scienziati. Mewtwo allora organizza un "falso" torneo dove solo gli allenatori forti accederanno, ovviamente Ash e i suoi amici compresi partecipano. Ash e gli altri una volta arrivati al torneo vengono privati dei loro Pokèmon da Mewtwo, che li usa per fare Pokèmon cloni. Così inizia una lotta tra i cloni e i Pokèmon normali, ma nessuno sembra avre la meglio. Mentre i Pokèmon lottano, Mew appare e sfida il suo clone... la lotta tra i due si fà sempre più spietata e i due rischiano di morire. Così Ash con un gesto eroico cerca di dividere i due mettendo a repentaglio la sua vita. Mewtwo viene toccato da quasto gesto così generoso. Fugge insieme a Mew andando alla ricerca dello scopo della sua vita. I ragazzi si ritrovano a terra e non ricordano più niente dell'accaduto, perchè Mewtwo prima di fuggire cancella la memoria a tutti i partecipanti del torneo.
